Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms