Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COBLO75128 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COBLO75128 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COBLO75128 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COBLO75128 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COBLO75128 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COBLO75128 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms