Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUTAO60888 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUTAO60888 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CUTAO60888 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUTAO60888 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUTAO60888 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms