Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AKAP8O43823 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms