Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LANCL1O43813 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms