Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1GO43497 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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