Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SYNJ1O43426 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SYNJ1O43426 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYNJ1O43426 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYNJ1O43426 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 668.8 ms