Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA2O43364 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms