Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCP110O43303 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCP110O43303 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCP110O43303 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCP110O43303 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCP110O43303 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms