Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD8O14715 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.58■■■□□ 2
RGPD8O14715 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD8O14715 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RGPD8O14715 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGPD8O14715 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGPD8O14715 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms