Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
O00370 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
O00370 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
O00370 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
O00370 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
O00370 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
O00370 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
O00370 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
O00370 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
O00370 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
O00370 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
O00370 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
O00370 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms