Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SOBPA7XYQ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOBPA7XYQ1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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