Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POTEMA6NI47 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POTEMA6NI47 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms