Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VWA3AA6NCI4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VWA3AA6NCI4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms