Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms