Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ST3GAL3-213ENST00000372365 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PAGE5-203ENST00000374955 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC064875.1-203ENST00000422996 582 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL35P8-201ENST00000433284 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC025262.1-201ENST00000434563 589 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GAPDHP61-201ENST00000507324 1005 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 KCTD21-AS1-204ENST00000528468 554 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC004477.2-201ENST00000583349 192 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NF1P7-201ENST00000612076 1530 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01692-201ENST00000441009 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 IL15-207ENST00000514653 1388 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CXCR2P1-201ENST00000439871 2503 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPSAP72-201ENST00000407020 358 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 BMP2KL-201ENST00000414251 1225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 VN1R35P-201ENST00000428102 693 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AZI2-207ENST00000457172 1136 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01094-206ENST00000514130 594 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 GZMB-205ENST00000526004 819 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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SCN2BO60939 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SOD1P2-201ENST00000563903 451 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC026468.1-201ENST00000614981 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 FO393401.2-201ENST00000422009 1307 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN2BO60939 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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