Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX9Q9Y5X1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX9Q9Y5X1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms