Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCDHB2Q9Y5E7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms