Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1Q9Y3T6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms