Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REXO2Q9Y3B8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms