Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LEMD3Q9Y2U8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LEMD3Q9Y2U8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms