Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMC3Q9UQE7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMC3Q9UQE7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms