Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NENFQ9UMX5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NENFQ9UMX5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms