Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRPF19Q9UMS4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF19Q9UMS4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms