Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNRF3Q9ULT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms