Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDRG4Q9ULP0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms