Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA3Q9UL41 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms