Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC2LQ9UL33 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms