Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GJD2Q9UKL4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GJD2Q9UKL4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms