Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSKSQ9UJT2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSKSQ9UJT2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms