Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIMS3Q9UJD0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIMS3Q9UJD0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms