Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PLXNA1Q9UIW2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLXNA1Q9UIW2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms