Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF639Q9UID6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF639Q9UID6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms