Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PUF60Q9UHX1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms