Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms