Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NPC1L1Q9UHC9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NPC1L1Q9UHC9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms