Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRP68Q9UHB9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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