Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO40Q9UH90 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms