Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHD7Q9P2D1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms