Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHRF1Q9P1Y6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHRF1Q9P1Y6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms