Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EHD2Q9NZN4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD2Q9NZN4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms