Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC5A4Q9NY91 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC5A4Q9NY91 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms