Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
MS4A12Q9NXJ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A12Q9NXJ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms