Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FBXO28Q9NVF7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO28Q9NVF7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms