Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GINM1Q9NU53 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms