Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNTG1Q9NSN8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms