Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM167BQ9NRX6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms