Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KANK2-202ENST00000587317 672 ntTSL 213.63□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.239e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PIK3R3-201ENST00000262741 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-204ENST00000465454 509 ntTSL 413.57□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTYH2-204ENST00000528128 532 ntTSL 413.55□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AL117339.1-201ENST00000419779 428 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-213ENST00000587294 937 ntTSL 513.49□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-211ENST00000587002 550 ntTSL 313.39□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-209ENST00000519141 1699 ntTSL 213.36□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF618-205ENST00000470105 2932 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-210ENST00000519362 1807 ntTSL 213.34□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R13L-208ENST00000592134 392 ntTSL 313.32□□□□□ -0.289e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-205ENST00000479697 5087 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DYNC1I2-213ENST00000430778 566 ntTSL 513.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-207ENST00000556303 539 ntTSL 213.28□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-208ENST00000481647 576 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-219ENST00000522321 760 ntTSL 413.26□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC019080.1-207ENST00000447413 1182 ntTSL 1 (best)13.23□□□□□ -0.294e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC27-203ENST00000468467 561 ntTSL 413.18□□□□□ -0.36e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CEP192-212ENST00000540847 2485 ntTSL 213.18□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TEK-203ENST00000519080 1543 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.32e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-211ENST00000592529 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 RNF34-206ENST00000554606 913 ntTSL 313.09□□□□□ -0.319e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 INTS13-209ENST00000544548 875 ntTSL 313.09□□□□□ -0.319e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM39B-208ENST00000487305 2087 ntTSL 213.07□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM131-208ENST00000485245 7476 ntTSL 1 (best)13.06□□□□□ -0.325e-11■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LINC00923-202ENST00000503874 1460 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRAK2-204ENST00000451703 646 ntTSL 313.02□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CYFIP1-210ENST00000619290 929 ntTSL 1 (best)13□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-209ENST00000557265 725 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-204ENST00000518085 3838 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-207ENST00000539408 760 ntTSL 512.92□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN5A-205ENST00000587340 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-217ENST00000588462 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.389e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CAST-218ENST00000507487 396 ntTSL 512.65□□□□□ -0.386e-12■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-203ENST00000517693 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 INTS13-203ENST00000537336 560 ntTSL 312.62□□□□□ -0.399e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 412.55□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1K-209ENST00000514204 2962 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-26■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-215ENST00000639146 1964 ntTSL 512.52□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SEC31B-203ENST00000469546 4396 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-215ENST00000529840 820 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 C12orf43-201ENST00000288757 4469 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PTOV1-AS2-201ENST00000593654 596 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-201ENST00000390652 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MR1-202ENST00000367578 1577 ntTSL 212.42□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ITIH5-207ENST00000476417 6945 ntTSL 212.33□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DHX37-206ENST00000544745 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TOR1AIP1-208ENST00000528443 3685 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 412.26□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-210ENST00000527852 582 ntTSL 512.26□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 DNAJC10-206ENST00000491074 3962 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ST3GAL4-207ENST00000524860 1012 ntTSL 312.2□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TSC2-218ENST00000562474 589 ntTSL 512.15□□□□□ -0.469e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TTN-AS1-240ENST00000590932 701 ntTSL 512.13□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MR1-203ENST00000367579 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BCAS3-203ENST00000408905 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-209ENST00000470247 374 ntTSL 512.12□□□□□ -0.472e-24■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZSCAN5A-209ENST00000588955 576 ntTSL 412.09□□□□□ -0.472e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ATP11A-213ENST00000489577 383 ntTSL 512.07□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF391-201ENST00000244576 4079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 HADH-213ENST00000638648 1910 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1K-202ENST00000505022 566 ntTSL 311.99□□□□□ -0.494e-26■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC8-204ENST00000578252 587 ntTSL 311.96□□□□□ -0.492e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF180-209ENST00000592095 3270 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FBXO3-206ENST00000529137 584 ntTSL 511.91□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 ABHD12-203ENST00000450393 615 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 KCNAB2-218ENST00000493807 560 ntTSL 311.8□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 MR1-201ENST00000282990 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NUBPL-209ENST00000551015 577 ntTSL 411.7□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 FANCA-227ENST00000567883 650 ntTSL 211.7□□□□□ -0.549e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 GABARAPL1-209ENST00000541453 584 ntTSL 311.69□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-211ENST00000555178 2200 ntTSL 511.69□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 EARS2-209ENST00000564461 675 ntTSL 211.68□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SNX6-201ENST00000362031 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 NUBPL-202ENST00000418681 1804 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 SLC35B1-211ENST00000508607 529 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1K-210ENST00000608933 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-26■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 AC091976.1-204ENST00000503504 492 ntTSL 511.5□□□□□ -0.579e-18■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 BIN2-202ENST00000544402 1990 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 TDP1-212ENST00000555565 524 ntTSL 511.43□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 223.6
UTP3Q9NQZ2 CNTROB-211ENST00000576536 561 ntTSL 311.42□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 223.6
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