Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEC31BQ9NQW1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEC31BQ9NQW1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms