Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NIT2Q9NQR4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms